Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms