Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A1P43005 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms