Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIA1P42261 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms