Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms