Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN7P35236 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms