Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RYKP34925 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RYKP34925 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RYKP34925 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RYKP34925 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms