Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCC1P33527 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC1P33527 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms