Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NIFKP1-201ENST00000398317 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01715-202ENST00000427804 688 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC034198.2-201ENST00000606447 510 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HOXD11P31277 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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