Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP1P30622 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP1P30622 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms