Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP1P29466 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP1P29466 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP1P29466 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP1P29466 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP1P29466 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP1P29466 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms