Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB2P29033 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB2P29033 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB2P29033 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms