Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBL1P28749 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBL1P28749 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBL1P28749 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBL1P28749 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms