Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPREP23469 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPREP23469 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPREP23469 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPREP23469 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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