Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms