Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms