Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFAP15692 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFAP15692 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFAP15692 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFAP15692 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms