Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms