Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms