Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX4O95219 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX4O95219 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX4O95219 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms