Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SERF1AO75920 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms