Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms