Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms