Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLGNO14967 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLGNO14967 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLGNO14967 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms