Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCBPO00560 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCBPO00560 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCBPO00560 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms