Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms