Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3CA6NKF2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms