Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TVP23AA6NH52 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms