Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6BA6NDN3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms