Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PALM3A6NDB9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PALM3A6NDB9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms