Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms