Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP5LA4QPB2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP5LA4QPB2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms