Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms