Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAD1L1Q9Y6D9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms