Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMED5Q9Y3A6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms