Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVW-1Q9UQF0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms