Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEU3Q9UQ49 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms