Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD4Q9ULV1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FZD4Q9ULV1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms