Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF608Q9ULD9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms