Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGA1Q9UJY5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms