Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms