Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHRF1Q9P1Y6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHRF1Q9P1Y6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms