Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALKBH4Q9NXW9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALKBH4Q9NXW9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALKBH4Q9NXW9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALKBH4Q9NXW9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms