Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms