Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms