Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms