Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms