Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms