Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms