Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP4Q9C0A0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms