Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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